En la primera llave, Deportivo Cali e Independiente Medellín reeditarán la final del primer semestre de 2015, siendo el equipo antioqueño el favorito tras terminar primero la fase de todos contra todos con 40 puntos.
El ganador de esa llave enfrentará al vencedor entre Cortuluá y Santa Fe, en el que será el primer partido de semifinales.
Por otro lado, Águilas de Rionegro jugarán ante Atlético Nacional; quien gane jugará contra el equipo que avance en la última llave de cuartos de final, Junior vs. Millonarios.
Cabe resaltar que también se sortearon los octavos de final de la Copa Águila, que se jugarán los días 27 de julio y 10 de agosto, así:
Real Cartagena-Atlético Nacional
DIM-Valledupar
Cúcuta-Equidad
América-Deportivo Cali
Patriotas-Envigado
Junior-Pasto
Quindío-Santa Fe
Millonarios-Tolima